Le choléra est une maladie diarrhéique épidémique, strictement humaine, due à des bactéries appartenant aux sérogroupes O1 et O139 de l’espèce Vibrio cholerae. Ce bacille fût initialement observé par Pacini en 1854 puis isolé en 1883 par Robert Koch en Inde. La bactérie V. cholerae sérogroupe O1, biotype El Tor, est répandue sur toute la planète, qui subit actuellement la septième pandémie de choléra. L’Organisation mondiale de la santé estime à près de 3 millions le nombre de cas et à plus de 95 000 le nombre de décès dus à cette maladie chaque année dans le monde. Toutes les régions du monde déclarent des cas de choléra, l’Afrique est le continent le plus touché et concentre plus de 50% des cas. Le taux global de létalité a été de 1,8%, en 2016, mais a dépassé les 6% parmi les groupes vulnérables résidant dans des zones à haut risque.

Le chikungunya est une maladie virale transmise à l’humain par la piqûre des moustiques Aedes albopictus et Aedes aegypti. Bien que rarement mortelle, cette maladie peut causer des douleurs significatives et une incapacité prolongée, affectant la qualité de vie des personnes touchées. Les traitements existants sont uniquement symptomatiques. Actuellement en France, 80% des départements rassemblent les conditions propices à l’émergence de la maladie. 

Les champignons (levures) du genre Candida peuvent provoquer des infections superficielles touchant les muqueuses et la peau et des infections viscérales : elles peuvent se limiter à un organe ou disséminer à travers l’organisme. Parmi les 200 espèces de Candida connues, une vingtaine est responsable d’infections humaines. Les levures Candida sont souvent responsables d’infections graves, survenant dans un contexte nosocomial.

La bactérie Helicobacter pylori (H. pylori) est l’agent causal de pathologies de l’estomac chez l'être humain : elle est responsable de gastrites chroniques, d’ulcères gastriques (plaies ouvertes qui se développent sur la muqueuse interne de l’estomac) et duodénaux. Elle joue un rôle important dans la genèse des cancers gastriques (adénocarcinomes et lymphomes). Ceci a conduit à réviser le traitement de la maladie ulcéreuse désormais considérée comme une maladie infectieuse, et pose d’une façon plus générale la question de l’éradication de cette bactérie (qui infecte 50% de la population mondiale) comme moyen de prévention des cancers gastriques.

Le cancer du col de l’utérus est le quatrième cancer le plus fréquent chez la femme dans le monde. Il est presque 100% imputable à une infection chronique par des virus appartenant à la famille des papillomavirus. À l’échelle mondiale environ 600 000 nouveaux cas, et plus de 300 000 décès, sont recensés chaque année. La maladie peut être prévenue grâce à des tests de dépistage réguliers. 

Le botulisme est une affection neurologique grave provoquée par une toxine très puissante produite par la bactérie Clostridium botulinum. Il existe différents types de botulisme : botulisme alimentaire, botulisme infantile ou botulisme contracté via une blessure. Si le botulisme est rare, sa mortalité reste élevée quand le traitement n’est pas précoce. 

L’Aspergillose est un terme qui regroupe les infections causées par des champignons appartenant au genre Aspergillus. Bien que toute la population soit exposée à ces champignons, présents dans l'environnement sous forme de spores, ils ne deviennent pathogènes que dans certaines conditions, notamment en cas d'immunodépression ou de maladies pulmonaires chroniques. Selon la condition de l'individu, les maladies causées par Aspergillus sont différentes.

L’amibiase est l’une des maladies parasitaires les plus meurtrières au monde (après le paludisme et la bilharziose). Environ 10% de la population mondiale serait infectée par des amibes parasites du genre Entamoeba dont la plus pathogène est Entamoeba histolytica, l’agent de l’amibiase. L’infection est souvent asymptomatique, mais peut cependant entrainer de nombreuses complications.