Grâce à des techniques de pointe de séquençage et de bio-informatique, des chercheurs de l’Institut Pasteur avec des confrères israéliens et chinois ont réussi à déterminer que les patients sévères présentaient une réponse des lymphocytes anormale et inefficace ainsi qu’une infiltration massive des poumons par des cellules inflammatoires.
Les patients atteints de Covid-19 (lire la fiche maladie Covid-19) présentent une grande diversité d’état clinique allant de formes légères, à des syndromes de détresse respiratoire nécessitant une assistance respiratoire. Bien que différents facteurs tels que l’âge, le sexe ou le poids ont été identifiés comme favorisant les formes sévères, les mécanismes biologiques participant à l’aggravation de la maladie restent peu clairs.
Dans un papier publié dans la prestigieuse revue ‘Cell’, l’équipe de Biologie des systèmes de l’Institut Pasteur, en collaboration avec l’Institut Weizmann (Israël) et le troisième hôpital populaire de Shenzhen (Chine), a étudié la réponse immunitaire à l’œuvre dans les poumons de patients souffrants de formes modérées et sévères de Covid-19.
Grâce à des techniques de pointe de séquençage et de bio-informatique, ces chercheurs ont réussi à déterminer que les patients sévères présentaient une réponse des lymphocytes anormale et inefficace ainsi qu’une infiltration massive des poumons par des cellules inflammatoires.
De plus, grâce à une nouvelle approche bio-informatique, ils ont pu identifier précisément les cellules infectées par le virus SARS-CoV-2, responsable de la maladie Covid-19, mais aussi mis en lumière la possibilité de co-infection par un autre virus respiratoire, le métapneumovirus humain, qui semble altérer profondément la réponse antivirale du patient.
Ce travail a été soutenu par le LabEx IBEID.
Source
Host-Viral Infection Maps Reveal Signatures of Severe COVID-19 Patients, Cell, 7 mai 2020
Pierre Bost,1,2,3,6 Amir Giladi,1,6 Yang Liu,4,6 Yanis Bendjelal,2 Gang Xu,4 Eyal David,1 Ronnie Blecher-Gonen,1 Merav Cohen,1 Chiara Medaglia,1 Hanjie Li,1 Aleksandra Deczkowska,1 Shuye Zhang,5 Benno Schwikowski,2,*Zheng Zhang,4,* and Ido Amit1,7,*
1 Department of Immunology, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel
2 Systems Biology Group, Department of Computational Biology and USR 3756, Institut Pasteur and CNRS, Paris 75015, France
3 Sorbonne Université, Complexité du vivant, Paris 75005, France
4 Institute for Hepatology, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People’s Hospital, School of Medicine, Southern University of Science and Technology, Shenzhen 518112, Guangdong Province, China
5 Shanghai Public Health Clinical Center and Institute of Biomedical Sciences, Fudan University, Shanghai 201508, China
6 These authors contributed equally
7 Lead Contact
*Correspondence: benno@pasteur.fr (B.S.), zhangzheng1975@aliyun.com (Z.Z.), ido.amit@weizmann.ac.il (I.A.)
Cette étude entre dans le cadre de l’axe scientifique prioritaire Maladies infectieuses émergentes du plan stratégique 2019-2023 de l’Institut Pasteur.