Activités de recherche du CNR des Vibrions et du Choléra

Les recherches de l’Unité des Bactéries Pathogènes Entériques concernent, la structure et l’évolution génétique des populations bactériennes entéropathogènes (E. coli, Shigella, Salmonella et vibrions), en particulier les populations émergentes, et/ou épidémiques et/ou résistantes aux antibiotiques et le développement de nouveaux outils de diagnostic.

Le CNRVC développe, conformément à son cahier des charges, des activités de recherche permettant : 

- Pour le choléra, d’aborder la surveillance et l’épidémiologie moléculaire par des méthodes  de typage telles que PFGE et MLVA, ainsi que l’étude de la résistance aux antibiotiques des souches de vibrions cholériques.
Le  séquençage complet de génome bactérien est actuellement en cours dans un cadre d’épidémiologie moléculaire.
- Pour les vibrions non cholériques, de contribuer à l’amélioration des capacités de surveillance et d’alerte dans le cadre d’une politique de prévention, par la mise au point de méthodes moléculaires de détection et d’identification dans les aliments et l’environnement et par l’étude de l’impact des modifications écologiques sur les différentes espèces de Vibrio pathogènes pour l’homme.
- Le CNR a également participé jusqu’en 2006 à des recherches portant sur la mise au point d’un nouveau vaccin contre le choléra. Dans ce cadre des anticorps monoclonaux spécifiques des lipopolysaccharides de V. cholerae O1 et de V. cholerae O139 avaient été préparés, ils ont été utilisés pour développer, en collaboration avec le Laboratoire d’Ingénierie des Anticorps de l’Institut Pasteur à Paris et avec l’Institut Pasteur de Madagascar, un test de diagnostic rapide du choléra détectant les 2 souches responsables du choléra : V. cholerae O1 et V. cholerae O139. Les compétences développées lors de ces études permettent aujourd’hui au CNR de participer à des évaluations de tests de diagnostic rapide du choléra, ou à des études de protection vaccinale.

PRINCIPALES PUBLICATIONS DU CNR DES VIBRIONS ET DU CHOLÉRA, CLASSÉES PAR THÈMES

Revues générales 
Jean-Michel Fournier, Marie-Laure Quilici, 2007, « Choléra ». La Presse Médicale, Dossier thématique Diarrhées Tropicales, 36, 727-739.

Lesne J. & Fournier J.-M. (2005). Vibrio. in « Bactériologie alimentaire, Compendium d’hygiène des aliments», sous la direction de M. Federighi . Economica, Paris. pp 189-217.

Fournier J.-M., & Quilici M.-L. (2002). Infections à vibrions non cholériques. Encycl Méd Chir (Editions Scientifiques et Médicales Elsevier SA, Paris) Maladies infectieuses, 8-026-F-15, 2002, 7 p.

Mulard L., Alonso J.-M., & Fournier J.-M. (2002). Vaccins polyosidiques. in : La vaccinologie. p. 37-54. Eds G.N. Cohen, P. Sansonetti. Annales de l’Institut Pasteur/actualités. Elsevier

Fournier J.-M. (1996). Choléra. in : Encyclopédie Médico-Chirurgicale, Maladies infectieuses. Elsevier, Paris, 8026-F-10, 5 p.

Méthodes de laboratoire 
Copin S, A. Rouxel, M. Cornu, A. Robert-Pillot, M.-L. Quilici, P. Malle and J. Lesne (2008). Optimisation of selective enrichment for the simultaneous isolation of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio cholerae in frozen raw seafood products, Sciences des Aliments, SDA 27_6.book, 398, août 2008, 4:26 16.

Bougoudogo F. & Fournier J.-M. (1997). Diagnostic bactériologique du choléra. Annales du Contrôle National de Qualité, n° 7, 79-89.

Dodin A., & Fournier J.-M. (1992). Méthodes de laboratoire pour le diagnostic du vibrion cholérique et des autres vibrions. (Trilingue : Français, Anglais, Espagnol). Commission des Laboratoires de Référence et d’Expertise de l’Institut Pasteur.
 

Epidémiologie 
Vezzulli L, Previati M, Pruzzo C, Marchese A, Bourne DG, Cerrano C; VibrioSea Consortium. (2010). Vibrio infections triggering mass mortality events in a warming Mediterranean Sea. Environ Microbiol, 12(7):2007-19.

Vezzulli L., Pezzati E, Moreno M, Fabiano M, Pane L, Pruzzo C & The VibrioSea Consortium. (2009). Benthic ecology of Vibrio spp. and pathogenic Vibrio species in a coastal Mediterranean environment (La Spezia Gulf, Italy), Microb Ecol, 58:808–18.

Lizarraga-Partida ML, Quilici ML (2009). Molecular analyses of Vibrio cholerae O1 clinical strains, including new nontoxigenic variants isolated in Mexico during the cholera epidemic years between 1991 and 2000, J Clin Microbiol, 47(5): 1364–71.

Ngandjio A, Tejiokem M, Wouafo M, Ndome I, Yonga M, Guenole A, Lemee L, Quilici ML and Fonkoua MC (2009). Antimicrobial resistance and molecular characterization of Vibrio cholerae O1 during the 2004 and 2005 outbreak of cholera in Cameroon, Foodborne Pathogens and Disease, 6 (1): 49-56.

Tarantola A., J. Vaucel, Céline Laviolle, M.-L. Quilici, J.-M. Thiolet and J.-M. Fournier (2008). A cluster of V. cholerae O1 infections in French travellers to Rajasthan (India), May 2006. J Travel Med., 15: 273–77.

Arnaud Tarantola, Sophie Ioos, Brice Rotureau, Christophe Paquet, Marie-Laure Quilici, Jean-Michel Fournier (2007). « Le choléra importé en France métropolitaine de 1973 à 2005 », BEH, n° 34, 297-99.

Cohen N, H. Karib, J. Ait Saïd, L. Lemee, A. Guenole & M.L. Quilici (2007). Prévalence des vibrions potentiellement pathogènes dans les produits de la pêche commercialisés à Casablanca (Maroc). Revue Méd. Vét., 2007, 158, 11, 562-68

Tarantola A, Quilici M.-L. on behalf of the laboratory investigation group (2007). Vibrio cholerae O1 strains with decreased susceptibility to fluoroquinolones in travellers returning from India (Rajasthan) to France, April 2007. Euro Surveill; 12(5):E070503.2. Available from http://www.eurosurveillance.org/ew/2007/070503.asp#2

Tarantola A, Ioos S, Rotureau B, Paquet C, Quilici ML, Fournier JM (2007). Retrospective analysis of the cholera cases imported to France from 1973 to 2005. J Travel Med., Jul-Aug; 14(4):209-14.

Quilici M.-L., Robert-Pillot A., Picart J., & Fournier J.-M. (2005). Pandemic Vibrio parahaemolyticus O3:K6 Spread, France. Emerg. Infect. Dis., 11, 1148-1149.

Quilici M.-L., Guénolé A., Lemée L., & Fournier J.-M. (2005). Les infections à vibrions non cholériques en France. Cas identifiés de 2001 à 2003 par le Centre National de Référence des Vibrions et du Choléra. Surveillance Nationale des Maladies Infectieuses, INVS,

Robert-Pillot A., Guénolé A., Lesne J., Delesmont R., Fournier J.-M., & Quilici M.-L. (2004). Occurence of the tdh and trh genes in Vibrio parahaemolyticus isolates from waters and raw shellfish collected in two French coastal areas and from seafood imported into France. Int. J. Food Microbiol. 91, 319-325.

Quilici M.-L., Guénolé A., & Fournier J.-M. (2003). Les infections à vibrions non cholériques en France. Cas identifiés de 1999 à 2001 par le Centre National de Référence des Vibrions et du Choléra. Surveillance Nationale des Maladies Infectieuses, 1998-2000. Editeur : IVS, pp. 193-196.

Hervio-Heath D., Colwell R.R., Derrien A., Robert-Pillot A., Fournier J.-M., & Pommepuy M. (2002). Occurrence of pathogenic vibrios in coastal areas of France. J. Applied Microbiol. 92, 1123-1135.

Geneste C., Dab W., Cabanes P.A., Vaillant V., Quilici M.-L. & Fournier J.-M. (2000). Les vibrioses non cholériques en France : cas identifiés de 1995 à 1998 par le centre national de référence. BEH, n°9, 38-40.

Duval P., Champetier De Ribes G., Ranjahaly J., Quilici M.-L., Fournier J.-M. (1999). Cholera in Madagascar. The Lancet, 353, 2068.

Germani Y., Quilici M.-L., Glaziou P., Mattera D., Morvan J. & Fournier J.-M. (1998). Emergence of cholera in the Central African Republic. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 17, 888-890.

Massenet D., Djerane L., Gamougane, K., & Fournier J.-M. (1995). Aspect bactériologique du choléra au Tchad (Epidémies de 1991 et 1994). Bull. Soc. Path. Ex., 88, 203-205.

Dumontier S., Escuyer V., Abachin E., Fournier J.-M., & Berche P. (1995). Chromosomal rearrangement in Vibrio cholerae O139. Bull. Inst. Pasteur, 93, 291-302.

Berche P., Poyart C., Abachin E., Lelievre H., Vandepitte J., Dodin A., & Fournier J.-M. (1994). The novel epidemic strain O139 is closely related to the pandemic strain O1 of Vibrio cholerae. J. Infect. Dis., 170, 701-704.

Bougoudogo F., Fournier J.-M., Gastellu-Etchegorry M., Guillou M., & Dodin A. (1992). Résistance de Vibrio cholerae O1 au composé O/129 et multirésistance aux antibiotiques. Bull. Soc. Path. Ex., 85, 136-141.
 

Cas cliniques
Renault P.A., Vargas C., Tachet A., Tattevin P., Najman A., Quilici M.-L. & Fournier J.-M. (2003). Septicémie à Vibrio vulnificus secondaire à une blessure par écrevisse. Presse Médicale, 32, 1028-1030.

Farmachidi J.-P., Sobesky R., Boussougant Y., Quilici M.-L., & Coffin B. (2003). Septicemia and liver abscesses secondary to non-O1/non-O139 Vibrio cholerae colitis. Europ. J. Gastroenter. Hepatol., 15, 699-700.

Aubert G., Carricajo A., Vermesch R., Paul G., & Fournier J.-M. (2001). Isolement de vibrions dans les eaux côtières françaises et infection à Vibrio cholerae non-O1/non-O139. Presse Médicale. 30, 631-633.

Ninin, E., Caroff N., El Kouri D., Espaze E., Richet H., Quilici M.-L. & Fournier J.-M. (2000) : Nontoxigenic Vibrio cholerae O1 bacteremia : case report and review. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 19, 489-491.

Infuso A., Devalk H., Marie C.-B., Fournier J.-M., Cadiot G., Andremont A., & Desenclos J.-C. (1998). Choléra autochtone à Paris. Une observation. Presse Medicale 27, 202-204.

Blanche P., Sicard D., Sevali Garcia J., Paul G., & Fournier J.-M. (1994). Septicemia due to non-O1 Vibrio cholerae in a patient with AIDS. Clin. Infect. Dis. 19, 813.

 

Nouvelles méthodes
Wang X.Y., Ansarruzaman M., Vaz R., Mondiane C., Lucas M.ES, von Seidlein L., Deen J.L., Ampuero S., Puri M., Park T., Nair G.B., Clemens J.D., Chaignat C.L., Rajerison M., Nato F., & Fournier J.-M. (2006). Field evaluation of a rapid immunochromatographic dipstick test for diagnosis of cholera in a high-risk population. BMC Infectious Diseases 6: 17. http://www.biomedcentral.com/1471-2334/6/17

Kalluri P., Naheed A., Rahman S., Ansaruzzaman M., Faruque A.S.G., Bird M., Khatun F., Bhuiyan N.A., Nato F., Fournier J.-M., Bopp C., Breiman R.F., Nair G.B., & Mintz E.D. (2006). Evaluation of three rapid diagnostic tests for cholera : does the skill level of the technician matter ? Trop. Med. & Intern. Health, 11, 49-55.

Boutonnier A., Dassy B., Duménil R., Guénolé A., Ratsitorahina M., Migliani R., & Fournier J.-M. (2003). A simple and convenient microtiter plate assay for the detection of bactericidal antibodies to Vibrio cholerae O1 and Vibrio cholerae O139. J. Microbiol. Methods, 55, 745-753.

Bhuiyan N.A., Qadri F., Faruque A.S.G., Malek M.A., Salam M.A., Nato F., Fournier J.-M., Chanteau S., Sack D.A., & Nair G.B. (2003). Use of dipsticks for rapid diagnosis of cholera caused by Vibrio cholerae O1 and O139 from rectal swab. J. Clin. Microbiol., 41, 3939-3941.

Nato F., Boutonnier A., Rajerison M., Grosjean P., Dartevelle S., Guénolé A., Bhuiyan N.A., Sack D.A., Nair G.B., Fournier J.-M., & Chanteau S. (2003). One-step immunochromatographic dipstick tests for rapid detection of Vibrio cholerae O1 and O139 in stools samples. Clin. Diagn. Lab. Immunol., 10, 476-478.

Robert-Pillot A., Guénolé A., & Fournier J.-M. (2002). Usefulness of R72H PCR assay for differentiation between Vibrio parahaemolyticus and Vibrio alginolyticus species : validation by DNA-DNA hybridization. FEMS Microbiol. Lett. 215, 1-6.

Robert-Pillot A., Baron S., Lesne J., Fournier J.-M., & Quilici M.-L. (2002). Improved specific detection of Vibrio cholerae in environmental water samples by culture on selective medium and colony hybridization assay with an oligonucleotide probe. FEMS Microbiol. Ecology 40, 39-46.
 

Programme de recherche sur la vaccination contre le choléra 
Ahmed F, André-Leroux G, Haouz A, Boutonnier A, Delepierre M, Qadri F, Nato F, Fournier J-M , Alzari P, (2008). Crystal structure of a monoclonal antibody directed against an antigenic determinant common to Ogawa and Inaba serotypes of Vibrio cholerae O1. Proteins –Structure Function and Bioinformatics, 70, 1, 284-288.

Grandjean C, Boutonnier A., Dassy B., Fournier J.-M and Mulard L. A. (2008). Investigation towards bivalent chemically defined glycoconjugate immunogens prepared from acid-detoxified lipopolysaccharide of Vibrio cholerae O1, serotype Inaba. Glycoconj J., Jul 23, DOI 10.1007/s10719-008-9160-6.

Grandjean C., Boutonnier A., Guerreiro C., Fournier J.-M., & Mulard L.A. (2005). On the preparation of carbohydrate-protein conjugates using the traceless Staudinger ligation. J. Org. Chem. 70, 7123-7132.

Liao X.M., Poirot E., Chang A.H.C., Zhang X.D., Zhang J.A., Nato F., Fournier J.-M., Kovac P., Glaudemans C.P.J. (2002). The binding of synthetic analogs of the upstream, terminal residue of the O-polysaccharides (O-PS) of Vibrio cholerae O1 serotypes Ogawa and Inaba to two murine monoclonal antibodies (MAbs) specific for the Ogawa lipopolysaccharide (LPS). Carbohyd. Res., 337, 2437-2442.

Chernyak A., Kondo S., Wade T.K., Meeks M.D., Alzari P.M., Fournier J.-M., Taylor R.K., Kovac P., & Wade W.F. (2002). Induction of protective immunity by synthetic Vibrio cholerae hexasaccharide derived from V. choleraeO1 Ogawa lipopolysaccharide bound to a protein carrier. J. Infect. Dis. 185, 950-962.

Boutonnier A., Villeneuve S., Nato F., Dassy B., & Fournier J.-M. (2001). Preparation, immunogenicity, and protective efficacy, in a murine model, of a conjugate vaccine composed of the polysaccharide moiety of the lipopolysaccharide of Vibrio cholerae O139 bound to tetanus toxoid. Infect. Immun., 69, 3488-3493.

Villeneuve S., Souchon H., Riottot M.-M., Mazié J.-C., Lei P.S., Glaudemans C.P.J., Kovac P., Fournier J.-M. & Alzari P. (2000). Crystal structure of an anti-carbohydrate antibody directed against Vibrio cholerae O1 in complex with antigen: molecular basis for serotype specificity. PNAS, 97, 8433-8438.

Villeneuve S., Boutonnier A., Mulard L.A., & Fournier J.-M. (1999). Immunochemical characterization of an Ogawa-Inaba common antigenic determinant of Vibrio cholerae O1. Microbiology, 145, 2477-2484.

Fournier J.-M. & Villeneuve S. (1998). Actualité du choléra et problématique vaccinale. Méd. Trop. 58, 32S-35S.

Wang J., Villeneuve S., Zhang J., Lei P.S., Miller C.E., Lafaye P., Nato F., Szu S.S.C., Karpas A., Bystricky S., Robbins J.B., Kovac P., Fournier J.-M., & Glaudemans C.P.J. (1998). On the antigenic determinants of the lipopolysaccharides of Vibrio cholerae O1, serotypes Ogawa and Inaba. J. Biol. Chem. 273, 2777-2783.

Bougoudogo F., Vely F., Nato F., Boutonnier A., Gounon P., Mazié J.-C., & Fournier J.-M. (1995) Protective activities of serum immunoglobulin G on the mucosal surface to Vibrio cholerae O1. Bull. Inst. Pasteur, 93, 273-283.

Mis à jour le 6 octobre 2023