Chikungunya is a viral disease transmitted to humans by the bite of Aedes albopictus and Aedes aegypti mosquitoes. Although rarely fatal, chikungunya can cause significant pain and debilitating symptoms that affect patients' quality of life. Existing treatments are solely symptomatic. In France, the current conditions in 80% of départements are conducive to the emergence of chikungunya.

Aspergillosis is a general term for infections caused by a type of mold (fungus) belonging to the genus Aspergillus. The mold that causes aspergillosis can be found everywhere in the environment in the form of spores, but in certain conditions it can become pathogenic, for example in immunocompromised people or those with chronic lung disease. The diseases caused by Aspergillus differ depending on the individual's state of heath.

Amebiasis is one of the most deadly parasitic diseases in the world (after malaria and schistosomiasis). Around 10% of the global population is thought to be infected with parasitic amoebae of the genus Entamoeba, the most pathogenic of which is Entamoeba histolytica, the amebiasis agent. Infection is often asymptomatic but it may result in multiple complications.

En 2012, un nouveau virus respiratoire fait son apparition en Arabie Saoudite. Baptisé MERS-CoV pour Coronavirus du Syndrome Respiratoire du Moyen-Orient, il touche le tractus respiratoire et est responsable de fièvre et de toux, pouvant entrainer la mort dans environ 30% des cas. Le virus est alors détecté dans plusieurs pays du Moyen-Orient. Depuis, 1219 cas ont été diagnostiqués, provoquant 449 morts. Quelques cas ont été détectés en Europe, dont 2 cas en France en 2013. Le 20 mai 2015, un cas provenant du Moyen-Orient est identifié en Corée du Sud, contaminant à ce jour (16 juin 2015) indirectement 154 personnes, dont 19 mortellement. A l’heure actuelle, aucun traitement spécifique ou vaccin n’est disponible contre ce virus. L’enjeu actuel est de contenir l’épidémie, puis de poursuivre les efforts de recherche pour mettre au point un vaccin et un traitement.

Le virus West Nile (ou virus du Nil occidental) est transmis à l’homme par les moustiques. Il entraîne une fièvre brutale, parfois associée à des complications neurologiques qui peuvent être sévères chez de nombreuses espèces animales. Depuis sa première identification en Afrique de l’Est, le virus a été identifié sur l’ensemble des continents. Aujourd’hui, il est endémique dans le pourtour méditerranéen, en Europe centrale et en Amérique du Nord où il est responsable de cas humains mortels comme il a été observé en Grèce continentale, en Italie du Sud et aux Etats-Unis.

La tuberculose (TB) est une maladie infectieuse, généralement pulmonaire, provoquée par la bactérie Mycobacterium tuberculosis. Hautement contagieuse, elle se transmet par l'air lorsque les personnes infectées toussent ou éternuent. Bien que la tuberculose puisse être mortelle, elle est souvent curable et peut être prévenue avec un diagnostic et un traitement approprié. 

L’Institut Pasteur est également promoteur d’un essai de thérapie génique pour le syndrome de Sanfilippo de type B, qui a débuté en octobre 2013, et qui a concerné quatre enfants âgés d’un an et demi à quatre ans. Des résultats ont été publiés le 13 juillet 2017 dans la revue Lancet Neurology. Après un suivi de 48 mois des quatre enfants traités, les scientifiques ont conclu que le traitement est sûr et bien toléré. Il est associé à une modification de l’évolution naturelle de la maladie chez certains des enfants traités. L’amélioration des performances neurocognitives semble être corrélée au traitement dès le plus jeune âge.Le syndrome de Sanfilippo est une maladie neurologique rare, incurable, d’origine génétique. Les premières manifestations dans l’enfance sont un retard d’acquisition cognitive et des troubles du comportement, qui évoluent progressivement vers une régression sévère des acquis psychomoteurs et un polyhandicap. La maladie est responsable d’une mort prématurée au début de l’âge adulte.

Les infections à streptocoques A (Streptococcus pyogenes) et B (Streptococcus agalactiae) sont fréquentes. Ces deux bactéries font partie de la flore commensale et ne causent des symptômes que dans certaines conditions (pathogène opportuniste) ou chez des personnes à risque. Le streptocoque A est responsable de nombreuses infections bénignes mais peut également être responsable d’infections invasives parfois mortelles. Le streptocoque B est responsable d’infections invasives graves (bactériémie, méningite) chez les nouveau-nés. 

Le SRAS (syndrome respiratoire aigu sévère) est la première maladie grave et transmissible à émerger en ce XXIe siècle. L’épidémie, partie de Chine fin 2002, a éclaté au niveau mondial en 2003 faisant plus de 8000 cas et près de 800 morts. Grâce à une mobilisation internationale sans précédent, motivée par l’alerte mondiale déclenchée le 12 mars 2003 par l’OMS, l’épidémie a pu être endiguée par des mesures d’isolement et de quarantaine. De même, l’agent causal du SRAS, un coronavirus inconnu jusqu’alors, a pu être rapidement identifié.

Le sepsis est le terme anglo-saxon et international employé pour caractériser une réponse inflammatoire généralisée associée à une infection grave. Le terme septicémie, créé en 1837 par le médecin français Pierre Piorry, à partir des mots grecs « Σήψις » (sêptikós), putrefaction, et « αίμα » (haîma), sang, désigne la présence de bactéries (voire de champignons ou de virus) dans le sang. Le sepsis affecte principalement les individus déjà fragilisés, les nouveau-nés et les personnes âgées, mais peut atteindre des personnes sans affection préalable. Au niveau mondial, on estime à 11 millions le nombre de décès par an des suites d’un sepsis. Les projections dans l’avenir suggèrent un doublement du nombre de cas d’ici cinquante ans, en particulier en raison du vieillissement de la population.