Christophe D’Enfert, directeur général adjoint scientifique de l’Institut Pasteur dresse un panorama rapide de l’année 2021, toutes disciplines confondues, avec un renforcement des capacités, des partenariats renforcés et technologies d’avenir.
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La prégnance forte du Covid sur les labos n’a pas empêché d’importantes avancées sur d’autres thématiques majeures.
Quels enseignements scientifiques tirer de deux ans de pandémie ?
L’Institut Pasteur a connu de nombreux succès. Grâce à la modélisation, l’évolution de l’épidémie a été suivie et anticipée en France. L’épidémiologie du virus a été mieux comprise avec l’étude ComCor. L’émergence des variants Delta et Omicron a été scrutée efficacement, grâce à l’expertise de nos CNR, essentiels dans notre organisation et centraux dans la détection des émergences. Nous avons produit des anticorps monoclonaux efficaces sur tous les variants connus, avec notre startup Spikimm, et développé un vaccin-nasal qui entre en phase clinique. La recherche de l’origine du virus progresse avec des travaux du Pasteur Network (Paris et Laos) sur les chauves-souris. Sans compter les publications sur la réponse immunitaire humorale, les cellules ciliées, l’anosmie, etc. Nous pouvons être fiers du travail accompli.
Ces succès n’ont pas freiné les recherches hors-Covid ?
En effet nous n’avons pas ménagé nos efforts, malgré le contexte parfois encore de confinement. Côté résistance aux agents antimicrobiens, les équipes pasteuriennes ont rejoint l’institut hors-mur Microbe UP lancé par Université Paris Cité. En neuroscience, des projets sont lancés avec l’Institut du cerveau. Dans le domaine des cancers, un accord sera renouvelé en 2022 avec l’Institut Curie. Enfin, une cellule va être créée pour tirer les leçons de la pandémie et se préparer aux prochaines émergences, dans une perspective internationale et avec nos partenaires, dont le Pasteur Network.
Les partenariats sont centraux en science ?
Ils ont toujours été importants et le seront de plus en plus dans un univers concurrentiel où le partage des compétences est une force. Le partenariat avec Université Paris Cité ouvre des opportunités en neurosciences, en microbiologie ou en immunologie. Notre Institut de l’Audition, où travaillent des équipes Pasteur et Inserm, élargit son expertise à l’étude du langage. Mais nous investissons aussi dans nos propres unités.
Quels autres investissements ont été faits ?
Huit projets de long terme « Covid » ont été lancés pour mieux comprendre le SARS-CoV-2 et la Covid-19 avec le recul nécessaire. Les équipements financés ici renforceront nos capacités pour de futures recherches, en parallèle des nombreuses technologies sur lesquelles nous investissons (cellule unique, imagerie, criblage molécules thérapeutiques, intelligence artificielle…). Nous avons aussi décidé la construction d’un Centre des maladies à transmission vectorielle, avec un environnement de travail ad hoc, qui devrait ouvrir d’ici à 2026. Ces projets préparent l’avenir et notre capacité à réagir aux futures émergences.
Les entités créées en 2021
L’unité Architecture et dynamique des macromolécules biologiques / Architecture and Dynamics of Biological Macromolecules, rattachée au département Biologie structurale et chimie. |
L’unité Codage neural et ingénierie des fonctions de parole / Neural coding and engineering of human speech functions, rattachée à l’Institut de l’Audition. L’U5 Neuroanatomie appliquée et théorique / Applied and Theoretical Neuroanatomy, rattachée au département Neuroscience. L’U5 Bactériophage, bactérie, hôte / Bacteriophage, Bacterium, Host, rattachée au département Microbiologie. L’U5 Virologie moléculaire avancée / Advanced Molecular Virology, rattachée au département Virologie. L’U5 Immunologie Translationnelle / Translational Immunology, rattachée au département Immunologie. L’U5 Mécanismes moléculaires du vieillissement pathologique et physiologique / Molecular Mechanisms of Pathological and Physiological Ageing, rattachée au département Biologie du développement et cellules souches. |
La plateforme d'innovation et de développement de tests diagnostiques / Diagnostic Test Innovation and Development Core Facility, rattachée au centre de ressources et recherches technologiques (C2RT), est adossée à l’Accélérateur de l’innovation de l’Institut Pasteur. Les plateformes Single Cell et Biomarqueurs / Biomarkers Platform & Single Cell Platform, au sein de l’UTechS Cytométrie et Biomarqueurs (UTechS CB). |
Le laboratoire Biologie des ARN de Plasmodium / Plasmodium RNA Biology, rattaché au département Parasites et insectes vecteurs. |
Le G5 Biologie cellulaire évolutive et évolution de la morphogenèse / Evolutionary cell biology and evolution of morphogenesis, rattaché au département Biologie cellulaire et infection. |
Par ailleurs, l’Institut Pasteur a lancé, en 2021, trois appels à candidatures pour la création de nouveaux groupes (G5 et G5+), dont les résultats seront annoncés en 2022, dans les thématiques suivantes (en anglais) :
- Computational Biology
- Cryo-electronic microscopy and tomography
- Priority axes:
- Emerging Infectious Disease with a focus on the interaction of epidemiological dynamics and evolution of pathogens,
- Antimicrobial resistance and novel antimicrobial strategies,
- Neuroscience: brain function and disease, in particular, leveraging the use of human models,
- Microbiome in human health,
- Single cell biology,
- Immunology with a focus on immunotherapy and cancer,
- Novel vaccine approaches.