Objectif : accroître la compréhension de l’origine, de l’histoire naturelle et de la dissémination du SARS-CoV-2 et des coronavirus apparentés (« SARS-like ») dans leur environnement naturel. Il s'agit en particulier de mieux comprendre la transmission inter-espèces (entre chauves-souris, entre chauve-souris et animal, entre chauve-souris et humain), primordiale pour atténuer de futures émergences, comme l’épidémie dévastatrice à laquelle nous assistons aujourd’hui avec le SARS-CoV-2 dans le monde.
Il est crucial de déterminer quelle(s) espèce(s) de chauves-souris sert/servent de réservoirs naturels pour le SARS-CoV-2. Ce projet reposera sur la collecte d’échantillons biologiques (écouvillons oraux et fécaux, échantillons de sang, urine) provenant de chauves-souris, et de rechercher la présence de SARS-CoV-2 et d'autres SARS-CoV, afin de déterminer leur hôte naturel. Ces virus seront également recherchés chez des mouches ectoparasites de chauves-souris et des insectes volants hématophages (phlébotomes, moustiques et petits diptères piqueurs), qui pourraient jouer un rôle dans la transmission des SARS-CoVs d'une chauve-souris à l'autre. L’observation des interactions avec d'autres animaux permettra d'identifier d'autres hôtes potentiels (serpents, civettes ou pangolins).