Le 8 juin, le directeur général de l’Organisation mondiale de la santé a déclaré que, bien que la situation épidémique de la maladie Covid-19 s’améliore en Europe, elle s’aggrave dans le monde, mettant en garde contre tout laisser-aller. La situation est en effet complexe. L’Institut Pasteur vous propose ici un point rapide pour y voir plus clair. Quels sont aujourd’hui les enjeux derrière la situation épidémique, les indicateurs de surveillance, et comment suivre et s’adapter à cette épidémie ? Tour d’horizon.

- Mis à jour le 6 juillet 2020 -

Le laboratoire de Découverte de pathogènes de l’Institut Pasteur et le laboratoire de neuropathologie de l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière ont initié une recherche de pathogènes dans des cas d’encéphalites mortelles d’origine inconnue. Chez deux patients immunodéprimés, le virus Umbre (genre orthobunyavirus) a été identifié. Ce virus infecte les neurones du cortex cérébral (il est dit neurotrope), la moelle épinière et le foie.

The Institut Pasteur's Pathogen Discovery Laboratory and the neuropathology laboratory at Pitié-Salpêtrière Hospital set out to identify pathogens in fatal cases of encephalitis of unknown etiology. In two immunosuppressed patients, the Umbre virus (genus Orthobunyavirus) was identified. This virus infects neurons in the cerebral cortex, the spinal cord and the liver. The discovery of a novel arbovirus responsible for encephalitis, and its existence in France, holds particular interest for public health.

An international study has demonstrated that the microbiota and the intestinal cell death triggered by chemotherapy stimulate the efficacy of the immune response in patients with colorectal cancer. The results of the study, conducted in France by scientists from Gustave Roussy, Inserm, Université Paris-Saclay, the Institut Pasteur, IHU Méditerranée Infection and INRAE, were published in the journal Nature Medicine. The scientists offer new insights that shed light on the mechanisms governing positive or negative responses to cancer treatments. 

Le microbiote et la mort cellulaire des cellules de l’intestin provoquée par la chimiothérapie stimulent l’efficacité de la réponse immunitaire des patients atteints d’un cancer du côlon. C’est ce que démontrent les résultats d’une étude internationale publiée dans la revue Nature Medicine et menée en France par des chercheurs de Gustave Roussy, l’Inserm, l’Université Paris-Saclay, l’Institut Pasteur, l’IHU Méditerranée Infections et l’INRAe.

Using state-of-the-art sequencing and bioinformatics techniques, scientists from the Institut Pasteur, working with fellow scientists from Israel and China, determined that patients with severe forms of COVID-19 presented an abnormal, ineffective lymphocyte response and a massive infiltration of inflammatory cells in the lungs.

Patients with COVID-19 (see the COVID-19 fact sheet)

The team of the Department of General Pediatrics and Infectious Diseases of the Necker-Enfants Malades AP-HP Hospital, the Institut Pasteur, Inserm and the University of Paris, conducted a prospective observational study between April 27 and May 15, 2020 to describe the characteristics of children and adolescents hospitalized in a context of Kawasaki disease-like syndrome in a COVID-19 epidemic context, with a systemic hyper-inflammatory expression. The results of this study were published on June 3, 2020 in the journal BMJ .

L’équipe du service de Pédiatrie générale et maladies infectieuses de l’hôpital Necker-Enfants malades AP-HP, de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et d’Université de Paris, a conduit une étude prospective observationnelle entre le 27 avril et le 15 mai 2020 pour décrire les caractéristiques d’enfants et adolescents hospitalisés dans un contexte de syndrome apparenté à la maladie de Kawasaki en contexte épidémique Covid-19, avec une expression hyper-inflammatoire systémique.

Grâce à des techniques de pointe de séquençage et de bio-informatique, des chercheurs de l’Institut Pasteur avec des confrères israéliens et chinois ont réussi à déterminer que les patients sévères présentaient une réponse des lymphocytes anormale et inefficace ainsi qu’une infiltration massive des poumons par des cellules inflammatoires.

Klebsiella bacteria are responsible for some of the most antibiotic-resistant infections. A major study on intestinal colonization by Klebsiella has shed light on human carriage of these strains in the community (i.e. outside hospitals) in low-income countries. This study reveals that controlling Klebsiella carriage is a complex challenge.