Du Yémen à Mayotte, diffusion d’une souche hautement résistante aux antibiotiques de l’agent du choléra

Des chercheurs du Centre National de référence des Vibrions et du choléra à l’Institut Pasteur, en collaboration avec le Centre hospitalier de Mayotte, ont mis en évidence la diffusion, depuis le Yémen, d'une souche hautement résistante aux antibiotiques de l'agent du choléra. Cette étude est publiée le 12 décembre 2024 dans le New England Journal of Medicine.

Le choléra est une maladie diarrhéique épidémique due à certaines bactéries de l’espèce Vibrio cholerae. Dans ses manifestations les plus sévères, le choléra est l’une des maladies infectieuses les plus rapidement mortelles : la mort peut survenir en quelques heures en l’absence de traitement. Ce dernier consiste essentiellement à compenser les pertes digestives d’eau et d’électrolytes. Les antibiotiques sont utilisés en complément de la réhydratation. Ils sont essentiels pour réduire la durée de l’infection et pour rompre les chaines de transmission au plus vite.

Une souche résistante à dix antibiotiques, dont deux des trois recommandés pour le traitement du choléra, l'azithromycine et la ciprofloxacine, avait été identifiée pour la première fois au Yémen lors de l'épidémie de choléra survenue en 2018-2019^[1].

Les scientifiques ont maintenant pu retracer la dissémination de cette souche grâce à l’étude des génomes bactériens. Après le Yémen, ils l’ont identifiée de nouveau au Liban en 2022^[2] puis au Kenya en 2023, et enfin en Tanzanie et aux Comores, dont Mayotte, département français situé au large de la côte sud-est de l'Afrique, en 2024. Entre mars et juillet 2024, l’île de Mayotte a été affectée par une épidémie de 221 cas causés par cette souche hautement résistante aux antibiotiques.

« Cette étude met en évidence le besoin de renforcer la surveillance mondiale de l’agent du choléra et en particulier de pouvoir connaître son comportement vis-à-vis des antibiotiques en temps réel. Si cette nouvelle souche qui se propage actuellement devait acquérir une résistante additionnelle à la tétracycline, cela compromettrait alors tout traitement antibiotique par voie orale » conclut le Pr François-Xavier Weill, responsable du CNR des Vibrions à l’Institut Pasteur et auteur principal de l’étude.